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推荐 | 9个最佳的大数据处理编程语言
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:174
大数据的浪潮仍在继续。它渗透到了几乎所有的行业,信息像洪水一样地席卷企业,使得软件越发庞然大物,比如Excel看上去就变得越来越笨拙。数据处理不再无足轻重,并且对精密分析和强大又实时处理的需要变得前所未有的巨大。 那么,在巨大的数据集中进行筛选[详细]
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基因数据处理36之qc-metrics安装
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:193
更多代码请见:https://github.com/xubo245/SparkLearning Spark中组件Mllib的学习之基础概念篇 1解释 Read and variant metrics,useable for pipeline quality control purposes qc-metrics主要是用于read和变异的度量,流水线质量控制的目的 2.代码: git[详细]
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基因数据处理34之使用samtools和bcftools进行变异分析
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:186
1.指令: (1) samtools mpileup -vf Homo_sapiens_assembly19chr20 .fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225058 .sorted .bam NA12878_snp_A2G_chr20_225058 .variants 或者: samtools mpileup -vf Homo_sapiens_assembly19chr20 .fasta NA12878_snp_A2G_chr20_[详细]
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推荐系统技术 --- 文本相似性计算(二)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:138
第一篇地址:推荐系统技术之文本相似性计算(一) 上一篇中我们的小明已经中学毕业了,今天这一篇继续文本相似性的计算。 首先前一篇不能解决的问题是因为我们只是机械的计算了词的向量,并没有任何上下文的关系,所以思想还停留在机器层面,还没有到更高的[详细]
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基因数据处理35之使用samtools和bcftools进行变异分析2--连续处
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:144
指令: samtools mpileup -uf Homo_sapiens_assembly19chr20 .fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer .sorted .bam | bcftools call -mv NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer .raw .vcf bcftools filter -s LowQual -e '%QUAL20 || DP100' NA12878_snp[详细]
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基因数据处理37之bdg-formats编译成功
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:84
更多代码请见:https://github.com/xubo245/AdamLearning 1解释 bdg-formats是在spark平台上用avro定义的基因处理的数据格式,包括read、sam、vcf、databaseannotion在云平台上的格式,主要用于Adam系统中 2.代码: 【2】下载 编译: mvn clean package -Dsk[详细]
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《hadoop进阶》PeopleRank从社交关系中挖掘价值用户
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:119
转载请注明出处: 转载自? Thinkgamer的CSDN博客: blog.csdn.net/gamer_gyt 代码下载地址:点击查看 1:PageRank 与 PeopleRank 2:需求分析:挖掘CSDN博客的价值用户 3:算法模型:PeopleRank算法 4:架构设计:从数据准备到PR算法的MR化 5:程序开发:had[详细]
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XTU 1247 Robb#39;s Problem
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:190
Robb’s Problem [ Submit Code ] [ Top 20 Runs ] Acceteped : 48 ? Submit : 335 Time Limit : 1000 MS ? Memory Limit : 65536 KB ? Description Robb’s Problem 题目描述 Robb想知道阶乘 n ! 第 m 位数码是什么? 输入 第一行是一个整数 T , ( 1 ≤ T[详细]
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基因数据处理38之dbSnpId到omimId的映射表
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:150
1.下载: 首先收到【2】,来源是【2】 【1】中有描述: You can also get those SNPs with an OMIM ID number by downloading from the dbSNP FTP site: the OmimVarLocusIdSNP table contains the information you need for your organisim of interest (hu[详细]
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基因数据处理26之avocado运行snap-basic有问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:72
hadoop@Master:~/xubo/data/testTools/se$ avocado-submit /xubo/avocado/hs2 .fq /xubo/avocado/hs38DH .fa /xubo/avocado/test20160527NUMhs2snap /home/hadoop/xubo/data/testTools/se/snap-basic .properties Using SPARK_SUBMIT=/home/hadoop/cloud/spa[详细]
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工具 | R高效数据处理包dplyr和data.table,你选哪个?
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:147
dplyr和data.table是R的两个高效数据处理包,这两个包有它们各自的优点。dplyr包的语法更加优雅,提供了更易于人类所能理解的自然语言。data.table包的语法简洁,并且只需一行代码就可以完成很多事情。进一步地,data.table在某些情况下执行效率更高(见这里[详细]
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如何挖掘大数据“钻石矿”? 李克强绘四大路径
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:85
中新社 刘震 摄 有人将大数据比喻为“21世纪的钻石矿”。如何在新一轮信息化潮流中抢得先机,掘得富矿?中国国务院总理李克强25日在中国大数据产业峰会暨中国电子商务创新发展峰会(以下简称:数博会)上发表致辞时,为此描绘出四大清晰路径。 路径一:大数据[详细]
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数据处理的 9 大编程语言
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:77
(点击 上方公众号 ,可快速关注) 英文:Anna Nicolauo 译者:伯乐在线 - 胡波 链接:http://blog.jobbole.com/100732/ 有关大数据的话题一直很火热。伴随着信息的爆炸式增长,大数据渗透到了各行各业,广泛应用于公司中,同时也使得传统的软件比如 Excel[详细]
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基因数据处理28之avocado运行
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:108
需要注意的是如果使用avocado的命令行,fs和fq为hdfs路径,properties为本地路径: hadoop @Master :~/xubo/data/testTools/se $ avocado-submit /xubo/avocado/hs1.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527 /home/hadoop/cloud/avocado/basi[详细]
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WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:103
标 题: WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程 时 间: 2013-03-17,15:22:33 这是本人第一次做漏洞挖掘,2月的时候开始研究漏洞挖掘技术,2月24号那天在进行Fuzz测试的时候偶然的发现了一个afd.sys未处理的异常,然后就对这个异常如获至宝的分析[详细]
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520我与大数据有个约会——上海大数据创新应用论坛完美落幕
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:51
2016年5月20日周五下午,由上海市大数据联盟牵头,慧与(中国)有限公司、联通小沃科技与华院数据共同承办,来自金融服务业、运营商、零售及电商、制造等行业的大数据应用先行者们为各行各业170余位来宾们打开了一扇通向大数据应用落地彼岸的智慧之门。会议由[详细]
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基因数据处理31之avocado运行avocado-cli中的avocado问题3-变异
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:91
读入的read为: val fqFile = "hs38DHSE1L100F1.sam" 读取结果: cleanedReads. count : 1 { "readNum" : 0 , "contig" : { "contigName" : "chrUn_KN707963v1_decoy" , "contigLength" : 62955 , "contigMD5" : null , "referenceURL" : null , "assembly"[详细]
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基因数据处理32之Avocado运行记录(人造数据集)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:196
主要是需要数据正确,如果中间缺少记录,avocado一般不会成功 1.代码: Avocado修改: /** * Licensed to Big Data Genomics (BDG) under one * or more contributor license agreements. See the NOTICE file * distributed with this work for additional[详细]
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基因数据处理30之avocado运行avocado-cli中的avocado问题1和2
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:96
问题1: avocado中的run方法中: println( "stats.coverage:" + stats .coverage ) 调用的是: lazy val coverage = ComputingCoverage.time { ScoreCoverage(inputDataset) } 然后报错: Exception in thread "main" java .lang .UnsupportedOperationExcep[详细]
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数据处理---Spring Batch之基础
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:51
? ? ? Spring框架提供了强大的底层结构,基于此,Spring出现了很多方面的应用。Spring Batch就是其一,它是一个轻量级的,完全面向Spring的批处理框架,可以应用于企业级大量的数据处理系统。Spring Batch以POJO和大家熟知的Spring框架为基础,使开发者更容[详细]
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数据处理---Spring Batch之实践
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:143
上面介绍了Spring Batch的基本概念和简单的demo项目,显然这些还是不够实际使用的。下面我们来更多的代码实践。 ? ? ? ? 在上面的基础项目上面,我们来更多的修改: ? ? ? ? 不用项目默认的hsql DB,用mysql,让ItemReader,ItemWriter 支持mysql; ? ? ? ? 支[详细]
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Pentaho BI Server的启动过程详解(二)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:141
时隔好久现在接着上一篇来继续聊一下Pentaho BI Server的启动过程,今天主要讲的就一个类PentahoSystem。 软件版本 Pentaho BIServer 5.0.1-ce 关于PentahoSystem 在上一篇文章里已经介绍过在SolutionContextListener中当应用启动时分调用PentahoSystem的ini[详细]
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【最强干货】关于文本挖掘的资料(文献,报告,策略,代码)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:90
查看之前文章请点击右上角 , 关注 并且 查看历史消息 所有文章全部分类和整理 , 让您更方便查找阅读。 请在 页面菜单里查找 。 今天没有策略研究推送。 有几篇文章还需再研究一下 好久没有给大家干货啦 今天给大家一些干货福利 文本挖掘方面的资料 文献,[详细]
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暴力:大数加法
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:174
Description The I-number of x is defined to be an integer y,which satisfied the the conditions below: 1. yx; 2. the sum of each digit of y(under base 10) is the multiple of 10; 3. among all integers that satisfy the two conditions above,y[详细]
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数据处理---Spring Batch之进阶
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:173
有了前面两篇的基础之后,我们一起来聊聊更高级的关于Spring Batch的话题。比如Job 配置;自定义各种Listener;控制步骤流程;自定义Reader,Processor,Writer;并行处理。这些东西在Spring Batch的使用中很多可能会需要的,当然还有更多的内容,最好找下文档[详细]